実験解析学 データベースの利用 2009年6月19日
講義資料 (URL)
A) 基礎知識と研究動向を知るためのサイト
1)
遺伝学関連の教育サイト
遺伝学電子博物館
http://www.nig.ac.jp/museum/msg.html
JSTサイエンスチャンネル
http://www.jst.go.jp/data/m14.html
DNA interactive (CSH)
DNA from the Beginning (CSH)
National
Center for Human Genome Research (NCHGR) Education
http://www.genome.gov/Education/
理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター（理研CDB）
http://www.cdb.riken.jp/jp/index.html
http://www.cdb.riken.jp/jp/05_development/0500_learningcenter.html
形質マッピングホームページ
生物多様性情報システム
http://www.biodic.go.jp/J-IBIS.html
東京医科歯科大学教養部生物和田 勝 細胞生物学
http://www.tmd.ac.jp/artsci/biol/textbook/celltop.htm
JST バイオインフォマティックス推進センター
生命科学Webラーニングプラザ詳細
http://weblearningplaza.jst.go.jp/
生命科学構造化センター
http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/
実験の手引き
bio:start
http://wiki.symplus.co.jp/bio/start
protocol-online
http://www.protocol-online.org/
東京大学分子細胞生物学研究所 核内情報分野 ラボマニュアル
http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/bnsikato/manual.htm
バイオアップデート
http://bioupdate.jp:8080/pages/viewpage.action?pageId=393219
化学物質情報
chem-station
国際化学物質安全性カード(ICSC)日本語版
2)
最新の研究動向を知る
バイオ系ポータルサイト
Nature
http://www.natureasia.com/japan/
Science
http://www.sciencemag.jp/index.cgi
Science Daily
Jabion 日本語バイオポータルサイト
3)
用語解説 データベースリンク集
スペースアルク
翻訳と辞書
ライフサイエンス辞書
http://lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/ja/index.html
Google
Scholar
http://books.google.co.jp/bkshp?hl=ja&utm_source=ja-wh
生物学分野のウィキポータル ウィキペディア（Wikipedia）。
http://ja.wikipedia.org/wiki/Portal:%E7%94%9F%E7%89%A9%E5%AD%A6
化学書資料館
https://www.chem-reference.com/
4)
製品紹介 求人 BIOMALL
Biotechnology Japan
http://biotech.nikkeibp.co.jp/BIO.shtml
Biocompare
http://www.biocompare.com/index.asp
バイオの買い物
JREC-IN（研究者人材データベース）
5)
科研費関連情報
文部科学省
特定領域リンク集
http://www.mext.go.jp/a_menu/shinkou/hojyo/020804.htm
日本学術振興会
科学技術振興機構
http://www.jst.go.jp/index.html
産総研
http://www.aist.go.jp/index_ja.html
B）研究に利用できるツール
WINGpro（データベースポータルサイト）ライフサイエンス分野のデータベース
http://wingpro.lifesciencedb.org/dbpwiki/index.php/
MEDALS（経済産業省統合データベースポータルサイト）
1)
解析ツール
研究留学ネット
http://www.kenkyuu.net/index.html
http://www.yk.rim.or.jp/~aisoai/molbio-j.html
NCBIゲノム解析ルールリンク集
http://www-bird.jst.go.jp/minicourses/
Molecular Tool Kit
http://www.vivo.colostate.edu/molkit/index.html
CBS
Prediction Servers
http://www.cbs.dtu.dk/services/
DDBJ 検索・解析サービス
http://www.ddbj.nig.ac.jp/searches-j.html
2)
モデル生物の情報
SHIGEN (Shared Information of Genetic resources)
http://www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm
国内の生物遺伝資源情報データベース
http://shigen.lab.nig.ac.jp/shigen/about/database.jsp
SHIGEN WGR (Worldwide Genetic Resources)
http://shigen.lab.nig.ac.jp/wgr/top/top.jsp
A Large Scale Mutagenesis Project in Riken GSC
http://www.gsc.riken.go.jp/Mouse/
GOD FATHER
マウス学術系統名の作成支ッール
http://www.shigen.nig.ac.jp/tools/godfather/index.jsp
リソースを入手するサイト
日本の遺伝資源提供サイト
http://shigen.lab.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp
Mouse Genome Informatics (Jackson Lab.)
http://www.informatics.jax.org/
The Arabidopsis information Resouces
CyanoBase
http://www.kazusa.or.jp/cyano/
SGD Saccharomyces cerevisiae genome database
Bacillus subtilis Genome Database
培養細胞を入手するサイト
ATCC (American Type Culture Collection:The
Global Bioresource Center)
培養.jp
CELLPEDIA
http://riodb.ibase.aist.go.jp/CELLPEDIA/cgi-bin/index.cgi?page=1
UBC Biomedia Image and
Movie Database(images and movies of cell structure from a wide variety of cell
types)
https://www.biomedia.cellbiology.ubc.ca/cellbiol/
バイオブックマーク
ライフサイエンス統合データベースセンター